DNA甲基轉移酶有兩種: (1)DNMT1,持續(xù)性DNA甲基轉移酶——作用于僅有一條鏈甲基化的DNA雙鏈,使其*甲基化,可參與DNA復制雙鏈中的新合成鏈的甲基化,DNMT1可能直接與HDAC(組蛋白去乙?;D移酶)聯(lián)合作用阻斷轉錄;(2)DNMT3a、DNMT3b從頭甲基轉移酶,它們可甲基化CpG,使其半甲基化,繼而全甲基化。從頭甲基轉移酶可能參與細胞生長分化調控,其中DNMT3b在腫瘤基因甲基化中起重要作用。
DNA去甲基化有兩種方式:
(1)被動途徑:由于核因子NF粘附甲基化的DNA,使粘附點附近的DNA不能被*甲基化,從而阻斷DNMT1的作用;(2)主動途徑:是由去甲基酶的作用,將甲基集團移去的過程。在DNA甲基化阻遏基因表達的過程中,甲基化CpG粘附蛋白起著重要作用。雖然甲基化DNA可直接作用于甲基化敏感轉錄因子E2F、CREB、AP2、CMyc?Myn、NF2κB、Cmyb、Ets,使它們失去結合DNA的功能從而阻斷轉錄,但是,甲基化CpG粘附分子可作用于甲基化非敏感轉錄因子(SP1、CTF、YY1),使它們失活,從而阻斷轉錄。
人們已發(fā)現(xiàn)5種帶有恒定的甲基化DNA結合域(MBD)的甲基化CpG粘附蛋白。其中MECP2、MBD1、MBD2、MBD3參與甲基化有關的轉錄阻遏;MBD1有糖基轉移酶活性,可將T從錯配堿基對T?G中移去,MBD4基因的突變還與線粒體不穩(wěn)定的腫瘤發(fā)生有關。在MBD2缺陷的小鼠細胞中,不含MECP1復合物,不能有效阻止甲基化基因的表達。這表明甲基化CpG粘附蛋白在DNA甲基化方式的選擇,以及DNA甲基化與組蛋白去乙酰化、染色質重組相互聯(lián)系中的有重要作用。